Bandomojo tipo „Zoanoid“ pabėga iš korporacijos „Kronos“ su trimis „Guyver“ vienetais. „Kronos“ kariai bando atgauti vienetus iš bandymo tipo, tačiau yra sužlugdyti, kai bandomasis tipas susprogdina bombą, kurią jis paslėpė savo krepšyje. „Guyver“ vienetai yra išsklaidyti sprogime. Du jauni gimnazistai, Sh? Fukamači ir Tetsuras? Segawa, suklupk pamestą Guyverio vienetą, vadinamą „I vienetu“. Antrąjį atgauna „Kronos“ ir susilieja su Oswaldu A. Liskeriu, kad vėliau taptų antruoju Guyveriu. Galutinis vienetas patenka į Agito Makishimos rankas, kuris nenustatytu laiku susilieja su juo. Sh? netyčia įjungia padalinį, kuris tada skausmingai susilieja su juo.
Laikui bėgant, Sh? sužino daugiau apie vedėją ir jo sugebėjimus. „Guyver“ yra praktiškai neliečiamas, jo vienintelė silpnoji vieta yra „Control Metal“. Nepažeisdama šios dalies, ji gali atstatyti pagrindinį kompiuterį nuo jame saugomų duomenų. Tačiau jei ši dalis yra pažeista, vienetą šeimininkas valgo gyvą ir praranda. Tai nesąmonė ir Sh? pradeda klausinėti, ar kada nors bus laisvas nuo Guyverio. Padėtis pamažu blogėja, pasirodžius nuolat galingesniems zoanoidams. Dėl to tampa vis sunkiau apsaugoti jo draugus, kurie nėra nemirtingi.
